El quinto subtipo de SMD del sistema de la OMS se llama SMD asociado con deleción 5q aislada, o del(5q). En este subtipo, los resultados de los exámenes de sangre son similares a los del subtipo AR, pero pueden incluir cantidades de plaquetas normales o altas. El examen citogenético realizado en la médula ósea mostrará una pérdida de parte del brazo largo del cromosoma 5, sin otras anomalías cromosómicas.