قد تكون مشاكل المهبل ناجمة أيضاً عن السرطان. سرطان المهبل هو نوع نادر من السرطان يمكن أن يسبب مشاكل في المهبل. يمكن علاج سرطان المهبل في كثير من الأحيان في مراحله المبكرة. نوع نادر آخر من السرطانات التي يمكن أن تسبب مشاكل المهبل هو سرطان الفرج. عادة ما يتطور ببطء على مدى عدة سنوات.