إذا كانت القرحةُ الهضمية ناتجة عن عدوى بكتيريا الملوية البوابية، فقد يصف الطبيبُ للمريض المضادات الحيوية. والمضادات الحيوية هي أدوية تستخدم من أجل معالجة العدوى البكتيرية.