يُصاب العديد من مرضى البيلَة الهيموغلوبينية الليليَّة الانتيابِيّة بانخفاض تعداد خلايا الدم. وهذا يعني أنه لا يوجدُ عندَ المريضِ ما يكفي من نوعٍ أو أكثر من أنواع خلايا الدم. وتشمل أكثر أنواع النقص شُيوعاً كُريات الدم الحمراء. ويُطلقُ على ذلك اسم فقر الدم.