يؤدي وجودُ داء كرون أيضاً إلى ازدياد خطر الإصابة بسرطان الأمعاء؛ فداءُ كرون يسبِّب التهاباً في جهاز الهضم. وهو يمكن أن يصيب أي منطقة ضمن هذا الجهاز، من الفم إلى الشرج. وغالباً ما يصيب داءُ كرون الجزءَ السفلي من الأمعاء الدقيقة.