يمكن أن يسبِّب الفيروس المضخِّم للخلايا مرضا شديداً عند الأطفال الذين أُصيبوا بهذا الفيروس قبل ولادتهم. وتُعرَف هذه الحالة بعدوى الفيروس المضخِّم للخلايا الخِلقي.